歷史沿革

遷校期

門訓原有校舍為一公寓式建築，沒有發展空間，日久不敷使用。1998年4月遷校至基隆市暖暖區源遠路297巷100號新址，並正式更名為「基督門徒訓練學院」。這是神藉一位愛主弟兄奉獻的土地，以及海內外眾教會肢體的同心禱告與奉獻，為門訓所成就的大事。這棟地上七層、地下一層的建築，座落在秀麗的月眉山邊、基隆河畔，環境清幽，不僅是提供主工人裝備的美好園地，也是進軍福音工場的沉潛基地。

遷校後、神帶領許多福音宣教機構，與本院建立合作計劃。例如海外基督使團、基督教中華海外宣道協會、中華威克里夫聖經翻譯協會、以色列福音差會等。他們或是委請本院代訓宣教士，或是慨允差派資深同工參與教學，並提供學生宣教、實習的機會；此外，本院也積極投入大陸的培訓事工。至於地區性的聯合事工，則與汐止、內湖等大台北地區及基隆眾教會密切配搭，例如提供場地使用、支援福音行動、開設外展課程及供應教學影音光碟等。期盼從神領受之資源，不僅能造就合神心意的時代工人、更能與神國度的眾教會，共同完成福音廣傳的大使命。

發展期

本院創校的前二十年雖未授予學位，但畢業生分散在海內外各地，從事牧會、宣教、神學教育、福音廣播、福音戒毒、監獄福音等事工，也都得到各方的肯定與好評。隨著在台灣受教育機會的普及，許多教會對傳道人學歷的認證，及不同宗派對聘牧資格的要求都有所提升，經透過對校友的問卷調查，取得大多數校友對門訓授予學位之肯定與期盼後，2001年1月董事會議決，於當年9月新學年度開始，實施新學制並頒授學位。分設教牧碩士、教牧學士、基層宣教科、教牧進修科四類，2006年增設聖經研究碩士科，使接受裝備者能有堅實之聖經基礎和靈命，並有活潑的恩賜與能力，能建立、牧養教會，作主聖工。

成長期

神帶領本院走過篳路藍縷草創惟艱的第一個十年，也帶領本院經歷遷校、發展的第二個十年。進入快速變化充滿挑戰的廿一世紀，門訓的腳步也在向成長中邁進。但所堅持的工人教育、全人教育、使命教育的理念依然不變，持守「不再是我、乃是基督」的校訓，看重「聖經、生命、恩賜」的平衡，並掌握時代與福音的脈動。2011年1月10日，在門訓即將跨入三十週年之際，經第九屆第四次董事會通過，再度更名為「基督門徒訓練神學院」。院名的定位促使在校同工思想學科整全的必要，並於二年後即2013年1月14日第十屆第四次董事會中提案討論增設「道學碩士」科，獲得全體出席董事通過，於2013年9月新學年度開始施行。